Hazret-i Osman zamanında çıkan fitne ateşi Dört büyük halifenin sonuncusu olan Hazret-i Ali zamanında da devam etti. Zamanındaki fitne ocağı olan Haricilere savaşmış ve hepsini de perişan etmişti. Bunlardan, kin ve intikam ateşiyle dolu olanlar, zaman zaman bir araya gelerek, nasıl intikam alacaklarını planlıyorlardı. Sonunda; Hazreti Ali , Hazreti Muaviye ve Hazreti Amr bin Âs'ı öldürmeğe karar verdileri. Hazreti Ali'yi , Abdurrahman bin Mülcem öldürecekti. İbnü Mülcem, Hazret-i Ali'i kollamağa başladı. Bir gün sabah namazından önce Halifenin geçeceği yola pusuya yattı. Hazreti Ali'nin geldiğini görünce İbni mülcem âniden arkadan üzerine atılarak zehirli kılıcını indirdi. Hazreti Ali ağır yaralıydı. Durmadan kan kaybediyordu. O vaziyette iken bile yanındakilere dönerek, camie gidip sabah namazını kılmalarını, vakti geçirmemelerini söyledi. Namazı kıldırmak için de yerine vekil tayin etti. Oğlu Hazreti Hasan'ı yanına çağırarak:"Bunun yemeğini yedirip istirahatini de temin edin. Eğer yaşayacak olursam ya affederim veya cezasını veririm. Eğer ölürsem, cezasını verin fakat aslâ haddi tecavüz ederek Müslümanların kanlarına girmeyiniz. Zira Allah haddi tecavüz edenleri sevmez" buyurdu. Kendisine, "Yâ Emire'l mü'minin, şayet size bir hal olursa oğlun Hasan'ı halife saçelim mi?" diye sordular."Ben bu hususta sizlere ne emrederim ve ne de nehyederim. Siz işinizi daha iyi bilirsiniz. Resûl-i Ekrem'in bu meseleyi bıraktığı gibi ben de bırakacağım." buyurdu. Durumu gittikçe ağırlaşyordu. Devamlı olarak kelime-i tevhid ile âyet-i kerimeler okuyordu. Bir ara yanına oğulları Hazreti Hasan ile Hazreti Hüseyin'i çağırdı. Onlara şu şekilde nasihatta bulundu: "Evlâtlarım! Sizlere Allah'a karşı müttaki olmanızı vasiyet ederim. Daimâ doğru söyleyin ve yetimlere acıyın. Âhiret için iyi ameller işleyerek sıkıntıya düşenlerin imdâdına koşun. Zâlimin hasmı olup mazluma daimâ yardım edin. Allah'n kitabı ile amel edin ve Allah yolunda olmaktan sizi hiçbirşey alakoymasın."Bu nasihatlerden sonra Hazreti Ali âyet-i kerimeler okumağa başladı. Vefatında, son sözü "Lâ ilâhe illallah Muhammedün Resûlullah" oldu.